Fiche de révision
Prescription et interprétation d'un examen microbiologique de selles
La plupart des diarrhées n'appellent aucun examen, et une recherche non demandée n'est pas faite.
Sommaire
Entretien et interrogatoire
⚠️ C'est l'interrogatoire qui décide s'il faut prescrire, et ce qu'il faut demander. ⚠️ Le laboratoire ne cherche que ce qu'on lui a nommé.
La diarrhée elle-même : ⚠️ son ancienneté, le nombre de selles, ⚠️ la présence de sang ou de glaires, la présence de fièvre, ⚠️ et la douleur. ⚠️ Du sang, une fièvre et des douleurs orientent vers une atteinte de la paroi et changent la prescription.
Le contexte, qui commande la demande : ⚠️ un voyage récent et son lieu, ⚠️ un repas partagé suivi de cas groupés, une prise d'antibiotique dans les semaines précédentes, ⚠️ une hospitalisation récente, une immunodépression, ⚠️ un métier au contact d'aliments ou d'enfants.
⚠️ Ce qui se demande sur le terrain : l'âge, une grossesse, ⚠️ une maladie chronique de l'intestin, et les traitements en cours.
Ce qui se recherche comme retentissement : ⚠️ la soif, la diminution des urines, la perte de poids, ⚠️ le malaise en se levant, et chez l'enfant, le refus de boire.
⚠️ Et ce qui se demande toujours avant de conclure : le patient a-t-il déjà pris quelque chose, antibiotique, ralentisseur du transit, ou traitement rapporté d'un voyage.
À retenir
- Le laboratoire ne cherche que ce qu'on lui a nommé.
- Sang, fièvre et douleurs orientent vers une atteinte de la paroi.
- Voyage, cas groupés, antibiotique récent : trois contextes qui changent la demande.
- Un métier au contact d'aliments ou d'enfants modifie la conduite collective.
- Un ralentisseur du transit déjà pris change l'évaluation.
En pratique
- Ancienneté et nombre de selles précisés
- Sang et glaires recherchés
- Fièvre recherchée
- Voyage récent et destination
- Cas groupés recherchés
- Antibiotique récent recherché
- Immunodépression et terrain précisés
- Traitements déjà pris recherchés
Examen clinique
⚠️ L'examen ne cherche pas la bactérie, il cherche la gravité, ⚠️ et c'est elle qui décide du lieu de soin avant tout résultat.
Ce qui se mesure : ⚠️ le poids, comparé au poids habituel, ⚠️ la pression artérielle debout et couchée, le pouls, la température, ⚠️ et la diurèse. ⚠️ Chez l'enfant, la perte de poids en pourcentage est le meilleur indicateur, et elle se calcule.
Ce qui se cherche comme signes de déshydratation : ⚠️ une sécheresse des muqueuses, un pli cutané persistant, ⚠️ des yeux creux, une somnolence ou une irritabilité, et chez le nourrisson, une fontanelle déprimée.
Ce qui s'examine sur l'abdomen : ⚠️ une douleur localisée, ⚠️ une défense, un météorisme important, ⚠️ l'absence de bruits. ⚠️ Un abdomen tendu et distendu chez un patient qui a reçu un antibiotique récemment est un tableau grave.
Ce qui se cherche ailleurs : ⚠️ une éruption, une atteinte articulaire, un ictère, et des signes de dénutrition dans les formes prolongées.
⚠️ Ce qui se conclut d'un examen rassurant : que le patient peut être traité à domicile, ⚠️ avec des consignes écrites et un délai de retour, et non que le problème est réglé.
À retenir
- L'examen cherche la gravité, pas la bactérie.
- Chez l'enfant, la perte de poids en pourcentage se calcule.
- Un abdomen tendu et distendu après un antibiotique récent est un tableau grave.
- La pression debout et couchée fait partie de l'examen.
- Un examen rassurant conduit à des consignes écrites, pas à un classement sans suite.
En pratique
- Poids comparé au poids habituel
- Pression debout et couchée
- Pouls et température
- Signes de déshydratation recherchés
- Perte de poids calculée chez l'enfant
- Abdomen palpé et ausculté
- Signes extra digestifs recherchés
- Consignes de retour données
Synthèse paraclinique
⚠️ Un examen microbiologique de selles n'est pas un examen mais une famille d'examens, ⚠️ et chacun se demande séparément.
⚠️ La recherche de bactéries : elle porte en routine sur un petit nombre d'espèces. ⚠️ Les autres ne sont cherchées que si elles sont nommées sur la demande, et une espèce non demandée n'est pas rendue.
⚠️ La recherche de parasites : c'est un examen différent, ⚠️ qui demande plusieurs prélèvements à des jours différents, parce que l'élimination est irrégulière. ⚠️ Un seul examen négatif n'écarte pas une parasitose.
⚠️ La recherche d'une toxine : elle se demande devant une diarrhée survenant après un antibiotique ou une hospitalisation, ⚠️ et elle ne fait pas partie de l'examen bactériologique courant.
⚠️ La recherche de virus : surtout chez le nourrisson et dans les épidémies collectives.
⚠️ Ce qui se lit ensuite : un résultat positif se confronte au tableau. ⚠️ Certaines bactéries et certains parasites peuvent être portés sans maladie, et leur présence n'établit pas à elle seule la responsabilité. ⚠️ Un résultat négatif n'écarte rien : le prélèvement peut avoir été fait trop tard, mal conservé, ou après un antibiotique.
À retenir
- Un examen de selles est une famille d'examens, chacun se demande séparément.
- Une espèce non nommée sur la demande n'est pas cherchée.
- La recherche de parasites demande plusieurs prélèvements à des jours différents.
- La recherche d'une toxine ne fait pas partie de l'examen bactériologique courant.
- Un résultat négatif n'écarte rien, un résultat positif ne prouve pas tout.
En pratique
- Recherche bactérienne demandée si indiquée
- Espèces particulières nommées
- Recherche parasitaire demandée à part
- Répétition des prélèvements prévue
- Recherche de toxine si contexte
- Recherche virale si nourrisson ou collectivité
- Résultat confronté au tableau clinique
- Limites du résultat négatif énoncées
Iconographie
Stratégie diagnostique
⚠️ La première décision n'est pas d'interpréter mais de savoir s'il faut prescrire. ⚠️ La plupart des diarrhées aiguës guérissent seules en quelques jours, et l'examen ne change alors rien.
⚠️ Ce qui fait prescrire, et la liste se retient : du sang dans les selles, ⚠️ une fièvre élevée ou persistante, une durée qui dépasse quelques jours, ⚠️ un retour de voyage, des cas groupés, ⚠️ une prise d'antibiotique ou une hospitalisation récentes, une immunodépression, ⚠️ un âge extrême ou une fragilité, et un métier exposant autrui.
⚠️ Ce qui ne fait pas prescrire : une diarrhée banale, brève, sans fièvre ni sang, chez une personne en bon état.
⚠️ Ce qui oriente la demande : le contexte plus que la clinique. ⚠️ Une diarrhée après antibiotique fait chercher une toxine ; ⚠️ un retour de zone tropicale fait chercher des parasites en plus des bactéries ; des cas groupés font chercher les causes alimentaires.
⚠️ Ce qui suspend la conclusion : un prélèvement fait après le début d'un antibiotique, ⚠️ un délai d'acheminement trop long, et un seul prélèvement quand une parasitose est suspectée.
⚠️ Et ce qui se pose devant une diarrhée qui dure : la question n'est plus infectieuse, et elle relève d'une autre démarche.
À retenir
- La première décision est de savoir s'il faut prescrire.
- Sang, fièvre, durée, voyage, cas groupés, antibiotique, terrain, métier : la liste qui fait prescrire.
- Le contexte oriente la demande plus que la clinique.
- Un prélèvement fait sous antibiotique suspend la conclusion.
- Une diarrhée qui dure sort du champ infectieux.
En pratique
- Indication de l'examen posée
- Sang et fièvre pris en compte
- Durée évaluée
- Voyage et cas groupés pris en compte
- Antibiotique récent pris en compte
- Terrain fragile identifié
- Demande orientée par le contexte
- Limites du prélèvement anticipées
Urgence vitale
⚠️ La diarrhée tue par la déshydratation, ⚠️ et le résultat de l'examen n'a aucune part dans cette urgence.
⚠️ Ce qui définit la gravité : une perte de poids rapide, ⚠️ une pression artérielle basse ou une chute en se levant, une accélération du pouls, ⚠️ une baisse de la diurèse, une somnolence ou une confusion, ⚠️ et chez le nourrisson, un refus de boire ou une perte de poids importante.
⚠️ Ce qui se fait sans attendre : la réhydratation, ⚠️ par voie orale quand elle est possible, par voie veineuse quand elle ne l'est pas, et la surveillance du poids et de la diurèse.
⚠️ Ce qui constitue l'autre urgence : une atteinte grave de la paroi du côlon, ⚠️ évoquée devant un abdomen distendu et douloureux, une fièvre élevée, ⚠️ et un contexte d'antibiothérapie récente. Elle relève d'un avis chirurgical et d'une imagerie sans délai.
⚠️ Ce qui ne se donne pas quand il y a du sang ou une fièvre élevée : un ralentisseur du transit, ⚠️ qui peut aggraver.
Ce qui se surveille : ⚠️ le poids, la diurèse et la conscience, ⚠️ et l'absence d'amélioration à 48 heures fait revenir sur le diagnostic.
À retenir
- La diarrhée tue par la déshydratation, et l'examen n'y a aucune part.
- Chez le nourrisson, le refus de boire est un signe de gravité.
- Un abdomen distendu après antibiothérapie récente impose un avis sans délai.
- Un ralentisseur du transit peut aggraver quand il y a du sang ou de la fièvre.
- L'absence d'amélioration à 48 heures fait revenir sur le diagnostic.
En pratique
- Poids et perte de poids évalués
- Pression debout et couchée
- Diurèse surveillée
- Conscience évaluée
- Réhydratation engagée
- Voie orale privilégiée si possible
- Complication colique recherchée
- Ralentisseur du transit écarté si sang ou fièvre
Stratégie de prise en charge
⚠️ Le traitement d'une diarrhée aiguë est la réhydratation, ⚠️ et l'antibiotique est l'exception.
⚠️ Ce qui se prescrit toujours : une réhydratation adaptée, ⚠️ une alimentation reprise rapidement et non suspendue, et des consignes écrites de retour.
⚠️ Ce qui fait envisager un antibiotique : un tableau sévère, ⚠️ du sang avec une fièvre élevée, un terrain fragile ou une immunodépression, ⚠️ et certains résultats précis. ⚠️ Dans plusieurs situations un antibiotique est au contraire déconseillé, et cette nuance se vérifie avant de prescrire.
⚠️ Ce qui se fait devant une diarrhée liée à un antibiotique : arrêter l'antibiotique en cause quand c'est possible, ⚠️ et traiter selon le résultat, la mesure la plus efficace étant l'arrêt.
⚠️ Ce qui ne se prescrit pas : un ralentisseur du transit en présence de sang ou d'une fièvre élevée.
⚠️ Ce qui se réévalue : l'état à 48 heures, ⚠️ et l'utilité de poursuivre ou d'arrêter un traitement engagé.
⚠️ Et ce qui s'organise et se néglige : le signalement. ⚠️ Des cas groupés après un même repas imposent une déclaration, et certaines maladies se déclarent quel que soit le nombre de cas, ⚠️ le réflexe se perdant dès que le patient va mieux.
À retenir
- Le traitement est la réhydratation, l'antibiotique est l'exception.
- L'alimentation se reprend rapidement, elle ne se suspend pas.
- Devant une diarrhée liée à un antibiotique, l'arrêt est la mesure la plus efficace.
- Un antibiotique est déconseillé dans plusieurs situations, cela se vérifie avant.
- Le réflexe de signalement se perd dès que le patient va mieux.
En pratique
- Réhydratation prescrite
- Alimentation reprise
- Consignes écrites remises
- Indication d'antibiotique évaluée
- Contre indications vérifiées
- Antibiotique en cause arrêté si besoin
- Réévaluation à 48 heures
- Signalement envisagé
Procédure et geste technique
⚠️ Le recueil décide de la valeur du résultat, ⚠️ et il se fait mal parce qu'on l'explique mal.
Ce qui s'explique au patient : ⚠️ le recueil d'une selle émise, dans un récipient propre prévu à cet effet, ⚠️ sans mélange avec les urines ni avec l'eau des toilettes, et une quantité suffisante.
⚠️ Ce qui compte autant : le délai. ⚠️ Une selle molle ou liquide doit parvenir rapidement au laboratoire, certaines recherches perdant leur sensibilité avec le temps, ⚠️ et une conservation au froid est parfois demandée. Le laboratoire indique ses conditions, et elles se lisent avant de prescrire.
⚠️ Ce qui se répète : la recherche de parasites, ⚠️ sur plusieurs prélèvements faits à des jours différents, le patient devant recevoir plusieurs récipients et une explication claire.
⚠️ Ce qui se prélève autrement : une recherche d'œufs autour de l'anus chez l'enfant, qui se fait le matin avant toute toilette, ⚠️ et non sur une selle.
⚠️ Ce qui s'écrit sur la demande : la date, le contexte, le voyage, l'antibiotique en cours, ⚠️ et les recherches souhaitées, nommées une par une.
À retenir
- Le recueil se fait mal parce qu'on l'explique mal.
- Ni urines ni eau des toilettes dans le récipient.
- Certaines recherches perdent leur sensibilité avec le délai.
- La recherche de parasites demande plusieurs prélèvements à des jours différents.
- La recherche d'œufs chez l'enfant se fait le matin, avant toilette, et non sur une selle.
En pratique
- Récipient adapté remis
- Absence de mélange expliquée
- Quantité suffisante expliquée
- Délai d'acheminement précisé
- Conservation expliquée si nécessaire
- Plusieurs récipients si recherche parasitaire
- Technique particulière expliquée chez l'enfant
- Contexte et recherches écrits sur la demande
Annonce et information
Éducation et prévention
⚠️ La transmission se fait par les mains et par ce qu'on avale, ⚠️ et l'essentiel des conseils tient à ces deux voies.
Ce qui se dit dans tous les cas : ⚠️ un lavage des mains après être allé aux toilettes et avant de préparer un repas, ⚠️ le fait de ne pas préparer les repas des autres tant que dure la diarrhée, et l'usage de linge et de serviettes séparés.
⚠️ Ce qui se dit sur la collectivité : une éviction est nécessaire dans certaines situations et pour certains métiers, ⚠️ notamment au contact d'aliments, de jeunes enfants ou de personnes fragiles, et sa durée dépend de la cause.
Ce qui se dit avant un voyage : ⚠️ la prudence sur l'eau, les crudités et les aliments crus, ⚠️ la vaccination quand elle existe, et le fait qu'une diarrhée au retour se signale plutôt qu'elle ne s'attend.
Ce qui se dit sur la réhydratation : ⚠️ comment la préparer et à quel rythme la donner, ⚠️ et chez le nourrisson, qu'elle se donne par petites quantités répétées.
⚠️ Ce qui se donne toujours par écrit : les signes qui doivent faire revenir, ⚠️ sang, fièvre élevée, refus de boire, somnolence, absence d'amélioration, et le délai au bout duquel il faut consulter.
À retenir
- La transmission se fait par les mains et par ce qu'on avale.
- Ne pas préparer les repas des autres tant que dure la diarrhée.
- L'éviction dépend de la cause et du métier.
- Chez le nourrisson, la réhydratation se donne par petites quantités répétées.
- Les signes de retour se donnent par écrit, avec un délai.
En pratique
- Lavage des mains expliqué
- Préparation des repas suspendue
- Linge séparé conseillé
- Éviction évaluée selon le métier
- Conseils de voyage donnés si pertinent
- Préparation de la réhydratation expliquée
- Rythme adapté au nourrisson
- Signes de retour écrits
Communication interprofessionnelle
⚠️ La demande adressée au laboratoire est le principal endroit où l'information se perd. ⚠️ Un examen prescrit sans contexte donne un résultat partiel, et le prescripteur croit avoir écarté ce qui n'a jamais été cherché.
Ce qui s'écrit sur la demande : ⚠️ la date de début, le voyage et sa destination, ⚠️ l'antibiotique reçu et sa date, une hospitalisation récente, ⚠️ une immunodépression, et les recherches souhaitées nommées une par une.
Ce qui se demande au biologiste : ⚠️ ce que le laboratoire cherche en routine et ce qu'il ne cherche que sur demande, ⚠️ et ses conditions de recueil et d'acheminement, qui varient d'un laboratoire à l'autre.
⚠️ Ce qui se transmet sans délai à la personne chargée de la veille sanitaire : des cas groupés après un repas commun, ⚠️ et certaines maladies à déclaration obligatoire, la déclaration étant une obligation et non une option.
Ce qui se transmet à la collectivité concernée : ⚠️ crèche, école, établissement, les mesures et leur durée.
⚠️ Et ce qui s'écrit dans le dossier : ce qui a été cherché, ce qui ne l'a pas été, ⚠️ et la conclusion retenue. Un résultat négatif sans la liste de ce qui a été demandé induit le lecteur suivant en erreur.
À retenir
- La demande est le principal endroit où l'information se perd.
- Le prescripteur croit avoir écarté ce qui n'a jamais été cherché.
- Les conditions de recueil varient d'un laboratoire à l'autre.
- La déclaration est une obligation, pas une option.
- Un résultat négatif sans la liste des recherches induit en erreur.
En pratique
- Date de début sur la demande
- Voyage et destination mentionnés
- Antibiotique récent mentionné
- Terrain mentionné
- Recherches nommées une par une
- Conditions du laboratoire vérifiées
- Signalement fait si nécessaire
- Recherches faites et non faites écrites au dossier
S'entraîner sur cette situation
Aucune station ne couvre encore cette situation.